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《中華胃腸外科雜志》創(chuàng)辦于1998年5月，目前是我國惟一的胃腸外科專業(yè)學(xué)術(shù)期刊。本刊的主要讀者對象為普通外科和胃腸外科及相關(guān)專業(yè)臨床、科研、教學(xué)的高、中級醫(yī)師。辦刊宗旨是：在貫徹執(zhí)行理論與實踐相結(jié)合、普及與提高相結(jié)合的方針，全面系統(tǒng)地反映國內(nèi)外胃腸外科領(lǐng)域的學(xué)術(shù)動態(tài)，促進(jìn)我國胃腸外科的學(xué)科發(fā)展和學(xué)術(shù)交流。本刊設(shè)有專題述評、專題論壇、述評、專家筆談、專題論著、論著、臨床報道、病例報告、臨床思維與訓(xùn)練、診治指南、文獻(xiàn)綜述、醫(yī)學(xué)信息等欄目；重點刊登胃腸外科及相關(guān)學(xué)科的主要研究成果和最新進(jìn)展方

本刊于2000年3月被吸收入國家科技部“中國科技論文統(tǒng)計源期刊”（中國科技核心期刊）；2005年3月又被國際上最具權(quán)威的生物醫(yī)學(xué)期刊數(shù)據(jù)庫——美國國立圖書館Medline數(shù)據(jù)庫收錄；2008年，又被北大圖書館收錄為臨床醫(yī)學(xué)核心期刊。同時，本刊還是《中國學(xué)術(shù)期刊（光盤版）》和中國期刊網(wǎng)全文數(shù)據(jù)庫收錄期刊，是中國學(xué)術(shù)期刊綜合評價數(shù)據(jù)庫來源期刊；同時被收錄為《中國核心期刊（遴選）數(shù)據(jù)庫》，還是《中國生物醫(yī)學(xué)核心期刊》。

自2009年6月1日起，本刊正式啟用“中華醫(yī)學(xué)會遠(yuǎn)程稿件管理系統(tǒng)”，完全實現(xiàn)了網(wǎng)上投稿、審稿、會審稿件和處理稿件，極大地提高了稿件的處理時效，方便和密切了雜志與專家、作者的聯(lián)系。為方便約稿、組稿和審稿，本刊還建立了專家資料數(shù)據(jù)庫、國家科研基金項目資料庫和作者的數(shù)據(jù)庫。

本刊一直以來，十分重視雜志的編輯質(zhì)量和出版水平。在2010年中華醫(yī)學(xué)會系列雜志125本雜志的編輯出版質(zhì)量綜合評審中，成績排名位列第四，獲得業(yè)內(nèi)一致好評。

中華醫(yī)學(xué)會雜志社是本刊的直接領(lǐng)導(dǎo)，自2007年游蘇寧擔(dān)任社長以來，對遠(yuǎn)離北京的中華醫(yī)學(xué)會系列雜志給予了更多的關(guān)心和支持。2010年7月，在中華醫(yī)學(xué)會雜志總社于北京舉辦的第四屆業(yè)務(wù)技能大賽上，本刊組成的“羊城旭日聯(lián)隊”經(jīng)過精心準(zhǔn)備前往參賽，通過四個項目的角逐，擊敗了駐京和京外其他雜志的所有對手，獲得了團(tuán)體冠軍！